Riassunto: Fondamenti di Biochimica

Schema del Corso

  1. Cellula e principi della biochimica
  2. Elementi e struttura delle biomolecole
  3. Reazioni e macromolecole
  4. Carboidrati e lipidi
  5. Proteine e amminoacidi
  6. Acidi nucleici e ATP
  7. Metabolismo ed energia cellulare
  8. Acqua e interazioni biologiche

1. Cellula e principi della biochimica

Concetti chiave e definizioni

  • Biochimica: Descrive le strutture, i meccanismi e i processi chimici che fanno parte degli organismi viventi.

★ Da sapere

  • La cellula svolge tre tipi di lavoro:

    • meccanico
    • osmotico
    • chimico
  • Le cellule si mantengono in uno stato stazionario dinamico lontano dall’equilibrio.

Approfondimenti

  • Ogni variazione chimica o fisica lascia costante la quantità totale di energia dell’universo.

  • Le attività degli organismi viventi dipendono da scambi di energia e materia mediati dall’ambiente.

2. Elementi e struttura delle biomolecole

★ Da sapere

  • Il carbonio forma legami covalenti stabili con altri quattro atomi e può costruire catene lunghe e resistenti.

  • I gruppi funzionali sono combinazioni specifiche di atomi che conferiscono proprietà caratteristiche alle molecole.

Approfondimenti

  • I gruppi funzionali ricorrenti sono:

    • metilico (–CH3)
    • ossidrilico (–OH)
    • carbossilico (–COOH)
    • amminico (–NH2)
    • carbonilico (–CO)
  • Gli elementi C, H, N e O corrispondono al 90% del peso cellulare.

  • Una cellula batterica può contenere fino a 5000 tipi diversi di composti organici.

Trucco mnemonico

Il carbonio tetravalente come snodo da cui partono quattro legami.

3. Reazioni e macromolecole

Concetti chiave e definizioni

  • Isomeri: Hanno la stessa formula molecolare ma differiscono per la disposizione degli atomi o dei gruppi funzionali, e si comportano diversamente nelle reazioni chimiche.

★ Da sapere

📌 La sintesi di un polimero avviene per condensazione, che libera una molecola d’acqua, mentre la sua demolizione avviene per idrolisi, che usa una molecola d’acqua per rompere i legami.

  • Le macromolecole elencate sono:
    • proteine
    • polisaccaridi
    • acidi nucleici

Approfondimenti

  • Le piccole molecole organiche cellulari hanno un peso molecolare compreso tra 100 e 1000 e contengono circa trenta atomi di carbonio.

  • Le categorie generali di reazioni cellulari sono: formazione o rottura di legami C–C, riarrangiamenti interni, isomerizzazioni ed eliminazioni, reazioni con radicali liberi, trasferimenti di gruppi chimici, ossidoriduzioni

Trucco mnemonico

La condensazione costruisce liberando acqua; l’idrolisi smonta usando acqua.

4. Carboidrati e lipidi

★ Da sapere

  • I carboidrati sono formati da carbonio, idrogeno e ossigeno con rapporto 1:2:1 e sono usati come fonti immediate di energia e componenti strutturali.

  • L’amido immagazzina glucosio nelle piante e il glicogeno negli animali e nei funghi; cellulosa e chitina hanno funzione strutturale rispettivamente nelle piante e in alcuni animali e funghi.

📌 Gli acidi grassi saturi non hanno doppi legami nella catena idrocarburica, mentre quelli insaturi ne hanno uno o più.

Approfondimenti

  • I carboidrati semplici comprendono monosaccaridi, costituiti da una molecola di zucchero, e disaccaridi, costituiti da due monosaccaridi.

  • La maggior parte dei lipidi è insolubile in acqua a causa delle catene idrocarburiche non polari, e i lipidi forniscono energia e protezione.

  • Tra gli argomenti sui lipidi figurano:

    • lipidi di riserva
    • acidi grassi
    • acilgliceroli
    • lipidi di membrana
    • ormoni steroidei
    • vitamine
    • lipoproteine

Trucco mnemonico

Il glicogeno immagazzina glucosio negli animali; la cellulosa sostiene le piante.

5. Proteine e amminoacidi

Concetti chiave e definizioni

  • Amminoacido: Formato da un atomo di carbonio centrale, un gruppo amminico, un gruppo carbossilico e un gruppo R variabile.

★ Da sapere

  • Le funzioni proteiche comprendono:

    • sostegno
    • metabolismo
    • trasporto
    • difesa
    • regolazione
    • movimento
  • La forma tridimensionale di una proteina è correlata alla sua funzione.

Approfondimenti

  • Le proteine dei viventi contengono una ventina di amminoacidi diversi, combinati in numerose sequenze possibili.

  • Cheratina e collagene contribuiscono rispettivamente al sostegno di capelli e unghie e di legamenti e tendini.

  • Gli enzimi catalizzano reazioni metaboliche, gli anticorpi contrastano gli agenti patogeni, l’insulina è un ormone proteico regolatore e actina e miosina partecipano al movimento muscolare.

6. Acidi nucleici e ATP

Concetti chiave e definizioni

  • Nucleotide: Formato da un gruppo fosfato, uno zucchero pentoso e una base azotata.

★ Da sapere

📌 Il DNA è un doppio filamento con desossiribosio e basi adenina, guanina, citosina e timina; l’RNA è a filamento singolo, contiene ribosio e usa uracile al posto della timina.

  • L’RNA convoglia le informazioni codificate nei geni dal DNA ai ribosomi per la sintesi proteica.

  • L’ATP è composto da adenina, ribosio e tre gruppi fosfato legati covalentemente tra loro.

Approfondimenti

  • Il DNA contiene l’informazione genetica e si trova all’interno del nucleo.

  • L’idrolisi enzimatica dei legami covalenti dei due gruppi fosfato più esterni dell’ATP libera molta energia.

7. Metabolismo ed energia cellulare

Concetti chiave e definizioni

  • Metabolismo: La rete coordinata di reazioni cellulari di catabolismo e anabolismo che produce e utilizza ATP.

★ Da sapere

📌 L’anabolismo è divergente, converte pochi precursori in molti prodotti e consuma ATP e NADPH, mentre il catabolismo è convergente, trasforma molte macromolecole in pochi prodotti finali e produce energia.

  • Le reazioni esoergoniche sono accoppiate a processi endoergonici per incanalare energia e produrre lavoro.

Approfondimenti

  • I prodotti finali comuni sono:

    • CO2
    • H2O
    • NH3
  • Ogni reazione cellulare è controllata da un enzima, ogni enzima è un prodotto genico e l’azione enzimatica è coordinata.

  • Le vie metaboliche sono evolutivamente conservate e gli ormoni integrano il metabolismo nei vari tessuti.

Trucco mnemonico

L’accoppiamento tra reazioni esoergoniche ed endoergoniche consente di incanalare energia per produrre lavoro.

8. Acqua e interazioni biologiche

★ Da sapere

  • L’acqua costituisce il 70% degli esseri viventi: il 50% è intracellulare e il 20% extracellulare, di cui il 5% è nel sangue e il 15% è interstiziale.

  • La polarità dell’acqua e i legami a idrogeno le conferiscono coesione, capacità di moderare i cambiamenti di temperatura, galleggiamento del ghiaccio e versatilità come solvente.

  • L’acqua partecipa direttamente a reazioni di condensazione e idrolisi, rispettivamente con perdita e aggiunta di una molecola d’acqua.

Approfondimenti

  • Nel ghiaccio ogni molecola d’acqua forma quattro legami a idrogeno con molecole adiacenti, creando una struttura cristallina regolare.

  • Le interazioni deboli comprendono:

    • legami ionici
    • interazioni idrofobiche
    • interazioni di van der Waals
    • legami a idrogeno
  • L’acqua trasporta sostanze nutritive, partecipa alle reazioni metaboliche, regola la temperatura corporea e contribuisce all’eliminazione di urea e corpi chetonici nelle diete ipocaloriche.

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Quali tipi di lavoro svolge la cellula usando energia?

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